私の彼女はバイオリンをオンラインで習っています。 初心者なのですが、中級者並の実力とセンスがあると講師も認めています。 私が違和感があるのはこの講師の方です

辞めさせたくないのは確かでしょうね。それが恋愛感情なのか生徒（金）を失いたくないからなのかは判断できませんが。

辞めるか続けるかは彼女の趣味なのですから彼女自身が決断することです。盗み聞きしていたとは言えないでしょうから会話の内容にも口出しできないでしょうし、彼氏だからといって辞めろと強いるのも良くないです。

あなたにできることは体調を気遣ったり、相談に乗ることや不安を聞いてあげること、アドバイスを求められたら助言することだと思います。