職場で会社物品がなくなったことでなぜか盗まれた物品が置いてある近くの席の私が疑われてるのですが、（みんなの態度が違う、無視されたり、噂で耳にした） なんと言え

冤罪、名誉毀損ってご存知ですか？
上司までグルになって無実の者を貶めるような社則でも在るのですか？社長にお伺いしてもよろしいでしょうか？
社会人にもなって幼稚ないじめ同然の個人攻撃に上司まで加わるような社風が、この会社の理念なんですか？
と返せるといいですけどね。

どちらにせよ、徒党を組んだ多数の一方的な言い分にのみ耳を傾ける上司は、クズ以外の何者でもないから、更に上に掛け合う方向で話を出したほうが良いです。
スレ主がその盗まれたと仕組まれた物に触れていないなら、指紋は検出されないでしょうし、身に覚えのない罪を着せられるなら、公的な第三者の調査を依頼する方向で警察に盗難の線で話をしましょう。

だいたいそこまでするとは思わず高を括っているはずですから、変に慌てて焦る輩が見えてくるはずです。