部下が辞める話になり、退職理由を「一身上の都合」ではなく「人間関係」と書いて提出し 私が主の原因になりました。 中途で入った部下がいて、仕事ができま

それって部下の立場からしたら、そりゃあ会社（上司）にとって都合のいい退職理由を書くよう言われるし、その場で「いえ、人間関係と書きたいです」と言っても絶対に許可されないでしょう？
ちゃんと固まった話なのに、って、部下が納得できない方向に強制的に固められた約束なんか守るわけないですよ
仕方ないからはいと言っておいていきなり違う退職理由を書く強硬手段に出るしかないじゃないですか
例えるなら、その場では脅迫されて書類書くまで逃がしてもらえないから書いたようなもので、その場合当然逃げたあとに「あの書類は脅迫で書きました」と無効を求めるでしょう

もう日本企業のそういう汚いやり方に素直に従っておいてくれるような都合のいい人は減ってるんですよ
主さんはどうせここにも自分に都合のいいことしか書いてないでしょ
そこまでするんだから部下から見たらまるで違う事実なのだろうなと思います
私も経験ありますから、会社というものの事なかれ主義嘘つき隠蔽体質は嫌になるほど知ってます