ママ友の名字を住んでる地名で呼んでしまっていたのが、ばれてしまい、その友達が地名で呼ぶなんてヒドイ！裏ではそう呼んでいたんだねと言ってよそよそしくなりました。

そうですね、受け取り方は人それぞれです。だから変な誤解を生まないものの言い方や言葉の選び方をしないといけないと思います。
主さんとしては、ただの地名じゃん？何でそんなに嫌なの？馬鹿にしてるつもりもないけど？直接言ってるわけじゃないし、私は気にならないけどって感じなんでしょうけど、そんなのは相手には関係なくて、相手に嫌だと思わせた時点でダメなんです。
現に、本人の前ではきちんと名前で呼んでるんですよね。じゃあそのまま名前で呼べば良いじゃん、って話だし、なのに裏で名前では呼んでない、外から見たらよくわかんない区別を主さんはしている、これって悪意あると受け取られても仕方ないですよ。主さんもご自分でおっしゃってますよね、つい口を滑らせて、と。ということは、良くない言い方だって自覚はあったのでは？？
自分の名前で呼ばれて、酷い、失礼だなんて言う人、おそらくいないですよね。無難な言葉を選んだ方が良いかと思います。