もう少しで中学3年生になるんですけど、少しでも内申点上げるために今よりも授業のノートを綺麗にまとめようと思います でも、どうすればいいのかよく分からないので何

内申点をあげるためにノートを綺麗にまとめるのはいいですが、綺麗に書くことだけに凝ってしまうと本末転倒です。
後で見やすいように、復習しやすいようにまとめましょう。板書は正確に書き、先生が言ったことで大事だと思うこと、黒板に走り書きしたようなことなど、メモ欄をあらかじめ、作っておくといい。
そのためには授業をしっかり聞くことです。私語なんてもってのほか。

内申点をあげるためには、授業を聞き、テストで得点をとる、提出物は期限をこさないようにする、中身も人のを写したりいい加減なことはしない、先生はそんなの見破るよ。
技能教科も手を抜かない。入試にはなくとも、内申点に影響を与えますよ。
うちの県は２倍になりますからね。

受験生だという自覚を早めにもって日々精進してください。
来年の春に合格通知が手に入りますことを願ってます。