19歳男子です。 ファミマでバイトをはじめて数ヶ月経ちました。ファミチキ等のフライヤー料理は通常数時間で廃棄するため作った時間と廃棄する時間をメモするのですが

法律家です。
簡単に言うとお店の商品は棄てる予定であったとしても所有権自体はお店にあります。
それを無断で食べてしまった場合は窃盗罪となります。
人の物を勝手に盗んだのと同じ道理です。
まだ若く罪の意識もないでしょうから、それを指摘されると腹が立つかもしれませんが、泥棒さんに怒る資格はあるのか？という点をご自身でよく考えてみてください。
社会では張り紙があってなかったから、教えられなかったからなどを理由にすることはできません。
人を殴って怪我させたとして、それが犯罪であることを知らなかったからと言って相手に対して腹を立て、自分は無罪であると主張するのでしょうか？

素直に自分の非を認め深く謝罪しましょう。
そうすれば店側も大事にはしないでしょう。