隣の家のエネファームがピーピーうるさいので、隣の人に直接苦情を言っていいですか？　ピーピーピーピーうるさい

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低周波音は、知覚するレベルの個人差が大きいそうです。
人によっては設置してる家の人も低周波音の被害にあうということもあるようです。
悪気があって設置をしたわけではないと思うので
ドアを蹴ったりといった乱暴な方法ではなくきちんと話をされた方がいいかと思います。

川崎市が「低周波音対策」というのをアップしているので、参考にされ隣に対策をとってもらえるようお願いしましょう。
対策には設置者もかなり費用がかかってしまうようなので、主さんもあまり手荒な態度でのぞまないよう配慮しながら、被害状況はしっかり伝えていく方がいいかと思います。