私は医者でも専門家でもないですが「あ…この子発達障害なんだろうな〜」と思う部下がいます。日々接している上で、おそらく親御さん方もどちらかもしくは両方とも発達障害

さほど小さな会社ではないようなので産業医いますよね？
一刻も早く人事に話して産業医に相談して下さい。その彼女のことも、主さん自身のこともです。
私はその彼女が、救いようのない人だとは思いません。ですが、自分の障害と向き合うにはクビも含めた少々荒療治が必要なようです。それは歳とってからより、少しでも若いうちのほうがいいです。今は発達障害も一般的になり、支援機関は沢山あります。主さんの元を離れたとしても、福祉関係者が彼女を助けます。
主さんの部下は彼女だけではないでしょう。もう充分頑張りました。本来の仕事に戻りましょう。もし、彼女がもう少し穏やかになって戻ってくることがあったら、その時温かく迎えてあげればいいです。