息子の幼稚園でいつも仲良しな子がいるのですが、A君がB君にB君といても面白くない 私息子君とは楽しいけど、B君とは遊びたくないと言ってたそうでB君は家で泣いて

子どもなりに、AくんにはBくんと遊びたくない理由があるんじゃないですか？
BくんがAくんにだけ意地悪するのかもしれないし、Aくんは息子くんと遊びたいからBくんと仲良くしてる姿を見ると嫉妬しちゃうのかもしれない。

勿論、原因があるからって、言っていいことと悪いことの区別は、6歳ならそろそろついてもいい頃だとは思いますが。
これくらいの年齢の子は、まだまだ個人差が大きいように思います。

うちの子が小学生の頃、全く同じようなことがありBママから相談を受けたときには、息子からAくんに理由を聞いてもらいました。
すると、BくんはふざけてAくんが嫌がることをしょっちゅうしていたことが判明し、私からBママに説明。
BママがしっかりBくんに指導してくれて、以降二人の仲が戻ったということがありました。

ですが、6歳じゃまだ仲介は難しいでしょうし…
私がBくんのお母さんなら園に相談（園でAくんと何かトラブルありましたか？と確認）すると思いますが、主さんと立場だと、様子見しかできないですね。