契約社員だと、上司からの指示は聞かないといけないのでしょうか？ 自分ばかり同僚の嫌がる重労働をやらされます。 大人しく聞いていましたが腰を痛めてしまいました

そこが「契約社員」と正社員の区別にされやすい名目ですよね。

だって、そこの社員がやりたがらない仕事を「契約社員」さんに受け持って貰ってるのですから。

私ならコルセット巻いて時間かけてその作業をするかな。(どんな作業かは知りませんが…)
遅い❗と言われたら…
「こういった作業で腰を痛めて病院にも行きましたが、なにぶん、他の方より腰を痛めてるので時間は掛かります…」としか言えませんね。

代わってくれなんて言える身分でもないでしょうし。
どう配慮するかは、その会社の上司や従業員の気遣い次第。