会社に退職の意思を伝えたら、納得できないようで、考え直してと言われました。 理由が転職ではないから、引き留められます。 辞める2ヶ月前に申告してるので、

退職理由はなんとでもなりますよ！
退職理由で１番多いのは人間関係って言われてますけど、面接で正直に言う人っていないしスキルアップのためとか何とでも言えると思いますしね。実際、体調不良が理由で退職したいってことなんですよね？
もっとひどくなって、例えば鬱とかになったら大変ですよ！もう働きたくても働けなくなってしまいますから。
人手不足なのは会社の責任で主さんの責任ではないですよ！
ただ、会社に追い詰められたとおっしゃいますが、きっかけはそうかもしれないですけどある意味主さんが自分で自分を追い込んだとも言えます。今こうしてなかなか決断できずに体調悪くしてるのは会社のせいですか？
むしろ、主さんがなんだかんだそうなるように選択して行動してるとも言えますよ。
人によってはもっと早く決断して、今の状況から脱してる人もいるでしょうしね。
辞めることだけが選択肢でもないですが。