主人に「毎日病気みたいに模様替えしやがって！」と怒られました。 病気みたいに、って言い過ぎではありませんか？大切にしていないから言える言葉なのではと、ショック

病気みたいにという言葉はひどいですね。
でもあまりに模様替えや片付けを頻繁にされると一緒に住んでいる者としては嫌な気持ちはよく分かります。場所が変わって分かりづらいというのもありますが、単純にバタバタしてて落ち着かないです。家では静かに落ち着かせてくれ！と思います。
ご主人が片付けをしないのはまた別問題なので、それはそれで普通に指摘すればいいと思います。あなたが模様替えをしまくっていることと関連付けて言うと揉めるでしょうから、そうでない時に普通に伝えましょう。