スーパーにくるお客様がオカマの人で毎日くるのですが、休憩室で売り場のじゃがいもを買っては電子レンジでチンしたりパンのミミを電子レンジでチンして食べてるみたいです

私も夫もスーパーで働いていて、うちのイートインスペースにも電子レンジなどを置いています。
常識的な範囲でご利用頂き、この場所で飲食をしながらおくつろぎ頂くためのサービスですが、常識的って言うのは機器の独占をしないように、機器や備品を汚したままにしてあとの人が困らないように、食品以外や電子レンジに入れられないものを入れないように、機器や備品を壊さないように、他のお客様の迷惑にならないように、こう言ったことです。
ジャガイモはダメとか、お惣菜やお弁当専用だとか、そんな事は決まってません。
調理しても構いませんよ、機器を独占したり、公共の場で刃物を使ったり、生ゴミを出したりしないで、数分の機器使用で出来る事なら。

それとスーパーはコンビニと違って電子レンジに不向きなお弁当も多く、またそのままレンジに入れてはいけない容器もあります。惣菜でも基本的には持って帰るための梱包なのでレンジには別な容器に入れ替えて頂きたい物も多いですし、匂いや食材破裂にも注意して温めて頂きたいんです。お弁当やお惣菜だから良いって事も無いんですよ。

主のお店で他のお客さんが何のクレームを入れたのか、出入り禁止にするほどの行為がどこにあったのかがよくわかりませんが、その人は土の付いたままレンジに入れてレンジ内を汚したままにしたとか、ラップせずに高温にして煙が出たとかそう言う事なのかも知れませんね。