現在大学4年で、卒業式終わりました。 しかし妊娠してしまいました。 彼氏も同い年です。 交際6年です。 彼とはいつかは結婚したかったので、それはいいので

まずは、妊娠おめでとうございます。

新人教育　経験者の意見として　未経験者を産休までの短い期間指導したのち　産休・育休で長期間休むとなると　復帰後に1から指導し直しになりますよね？教育係としては最初の指導が無駄になると推測できますので　熱心に指導する気がなくなります。
内定を断るか、入社時期を産後に変更してもらうのが良い選択だと思います。