私は衛生面的な潔癖（お肉を触った手で他の場所を触るのを必要以上に気をつける、敏感になる）なところがあり、彼は人に対し潔癖（公共機関の椅子、吊り革、ボタン、コンビ

主さんはHSP気質で彼はASDの傾向があるとかなんじゃないですか？
潔癖もそれらの特性の一部なのかな。
それなら潔癖は似ているように見えても思考回路は正反対ですよ。

どちらが間違っているとかではなく、他人同士なんだから違って当然ですし、自分はこんなにしてあげてるのにー！って期待し過ぎないことです。
どうにも合わないとか、お互いに合わせられないと思うなら一緒にいてもしんどいので、別れた方が良いでしょうね。