パートさんが休みの時、会社に電話します。それが始業前なのが普通だと思うんですが、事務員が「私は始業前なので電話に出ません。まだ仕事を始めてません。」といってきま

パートに、「連絡を入れる際は事務員に用件を伝えて切るように」では上手くいかないものですかね。

「○○です。□□なので本日は休みます。（主さん）には連絡済みです、よろしくお願いします」で切る。そもそも現状の流れで、パートが事務員任せで主さんに繋がれるの待ってるのもおかしな話しですよね。

言っても聞かない事務員なら、パートに徹底させればいいのでは？

馬鹿かどうかはどうでもいいことです。どのみち馬鹿を使いこなせない奴も相応の馬鹿の場合が多いですので。